MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK

Total Repeats: 6592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010418	TTACT	2	10	211	220	20 %	60 %	0 %	20 %	169834813
2	NC_010418	T	7	7	224	230	0 %	100 %	0 %	0 %	169834813
3	NC_010418	ATC	2	6	276	281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834813
4	NC_010418	TCT	2	6	290	295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834813
5	NC_010418	ATA	2	6	329	334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834813
6	NC_010418	TAC	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834813
7	NC_010418	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
8	NC_010418	ATT	2	6	483	488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
9	NC_010418	TAT	2	6	512	517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
10	NC_010418	T	6	6	520	525	0 %	100 %	0 %	0 %	169834813
11	NC_010418	T	6	6	591	596	0 %	100 %	0 %	0 %	169834813
12	NC_010418	TAA	2	6	600	605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834813
13	NC_010418	AGA	2	6	618	623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834813
14	NC_010418	TTC	2	6	673	678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834813
15	NC_010418	AGC	2	6	686	691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834813
16	NC_010418	T	6	6	699	704	0 %	100 %	0 %	0 %	169834813
17	NC_010418	ATT	2	6	783	788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
18	NC_010418	T	6	6	813	818	0 %	100 %	0 %	0 %	169834813
19	NC_010418	TAA	2	6	870	875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834813
20	NC_010418	T	6	6	893	898	0 %	100 %	0 %	0 %	169834813
21	NC_010418	TTTA	2	8	921	928	25 %	75 %	0 %	0 %	169834813
22	NC_010418	TTA	2	6	952	957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
23	NC_010418	ATA	2	6	985	990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834813
24	NC_010418	AAT	2	6	1014	1019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834813
25	NC_010418	TAG	2	6	1028	1033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834813
26	NC_010418	TCA	4	12	1075	1086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834813
27	NC_010418	T	6	6	1101	1106	0 %	100 %	0 %	0 %	169834813
28	NC_010418	CTA	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834813
29	NC_010418	TTTGTT	2	12	1229	1240	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	169834813
30	NC_010418	TTC	2	6	1245	1250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834813
31	NC_010418	TTA	2	6	1280	1285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
32	NC_010418	TAC	2	6	1326	1331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834813
33	NC_010418	TTC	2	6	1338	1343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834813
34	NC_010418	T	6	6	1352	1357	0 %	100 %	0 %	0 %	169834813
35	NC_010418	A	6	6	1363	1368	100 %	0 %	0 %	0 %	169834813
36	NC_010418	TAT	2	6	1394	1399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
37	NC_010418	AATT	2	8	1404	1411	50 %	50 %	0 %	0 %	169834813
38	NC_010418	CAT	2	6	1484	1489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834813
39	NC_010418	AT	3	6	1517	1522	50 %	50 %	0 %	0 %	169834813
40	NC_010418	TAT	2	6	1542	1547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
41	NC_010418	ATATT	2	10	1550	1559	40 %	60 %	0 %	0 %	169834813
42	NC_010418	AG	3	6	1666	1671	50 %	0 %	50 %	0 %	169834813
43	NC_010418	CATTT	2	10	1689	1698	20 %	60 %	0 %	20 %	169834813
44	NC_010418	AAT	2	6	1717	1722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834813
45	NC_010418	ACC	2	6	1738	1743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169834813
46	NC_010418	T	6	6	1746	1751	0 %	100 %	0 %	0 %	169834813
47	NC_010418	CTTT	2	8	1757	1764	0 %	75 %	0 %	25 %	169834813
48	NC_010418	T	7	7	1779	1785	0 %	100 %	0 %	0 %	169834813
49	NC_010418	ATTA	2	8	1875	1882	50 %	50 %	0 %	0 %	169834813
50	NC_010418	ATA	2	6	1896	1901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834813
51	NC_010418	AT	3	6	1941	1946	50 %	50 %	0 %	0 %	169834813
52	NC_010418	TAA	2	6	2034	2039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834813
53	NC_010418	TA	3	6	2046	2051	50 %	50 %	0 %	0 %	169834813
54	NC_010418	AT	3	6	2071	2076	50 %	50 %	0 %	0 %	169834813
55	NC_010418	TTTTAG	2	12	2081	2092	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	169834813
56	NC_010418	T	6	6	2107	2112	0 %	100 %	0 %	0 %	169834813
57	NC_010418	TGTT	2	8	2136	2143	0 %	75 %	25 %	0 %	169834813
58	NC_010418	CTT	2	6	2165	2170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834813
59	NC_010418	T	7	7	2169	2175	0 %	100 %	0 %	0 %	169834813
60	NC_010418	T	6	6	2177	2182	0 %	100 %	0 %	0 %	169834813
61	NC_010418	A	6	6	2189	2194	100 %	0 %	0 %	0 %	169834813
62	NC_010418	ATT	2	6	2208	2213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
63	NC_010418	CAC	2	6	2243	2248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169834813
64	NC_010418	TAT	2	6	2253	2258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
65	NC_010418	AGT	2	6	2259	2264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834813
66	NC_010418	TCTTT	2	10	2269	2278	0 %	80 %	0 %	20 %	169834813
67	NC_010418	ATATT	2	10	2296	2305	40 %	60 %	0 %	0 %	169834813
68	NC_010418	T	9	9	2307	2315	0 %	100 %	0 %	0 %	169834813
69	NC_010418	TCA	2	6	2320	2325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834813
70	NC_010418	TTC	2	6	2367	2372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834813
71	NC_010418	GTTC	2	8	2386	2393	0 %	50 %	25 %	25 %	169834813
72	NC_010418	TCA	2	6	2407	2412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834813
73	NC_010418	ACTA	2	8	2448	2455	50 %	25 %	0 %	25 %	169834813
74	NC_010418	TA	3	6	2454	2459	50 %	50 %	0 %	0 %	169834813
75	NC_010418	ATTTTC	2	12	2460	2471	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169834813
76	NC_010418	TAT	2	6	2544	2549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834813
77	NC_010418	AT	3	6	2560	2565	50 %	50 %	0 %	0 %	169834813
78	NC_010418	TAT	2	6	2669	2674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
79	NC_010418	T	7	7	2691	2697	0 %	100 %	0 %	0 %	169834949
80	NC_010418	T	6	6	2702	2707	0 %	100 %	0 %	0 %	169834949
81	NC_010418	TA	4	8	2714	2721	50 %	50 %	0 %	0 %	169834949
82	NC_010418	T	6	6	2734	2739	0 %	100 %	0 %	0 %	169834949
83	NC_010418	ATT	2	6	2763	2768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
84	NC_010418	AATT	2	8	2769	2776	50 %	50 %	0 %	0 %	169834949
85	NC_010418	TTC	2	6	2802	2807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834949
86	NC_010418	TTA	2	6	2845	2850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
87	NC_010418	TAA	2	6	2855	2860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834949
88	NC_010418	CAT	2	6	2864	2869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834949
89	NC_010418	T	6	6	2902	2907	0 %	100 %	0 %	0 %	169834949
90	NC_010418	CTT	2	6	2941	2946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834949
91	NC_010418	GCCAA	2	10	2977	2986	40 %	0 %	20 %	40 %	169834949
92	NC_010418	ATT	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
93	NC_010418	TAG	2	6	3011	3016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834949
94	NC_010418	ATT	2	6	3064	3069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
95	NC_010418	ATT	2	6	3078	3083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
96	NC_010418	TTC	2	6	3114	3119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834949
97	NC_010418	ATAG	2	8	3139	3146	50 %	25 %	25 %	0 %	169834949
98	NC_010418	A	7	7	3165	3171	100 %	0 %	0 %	0 %	169834949
99	NC_010418	TA	4	8	3185	3192	50 %	50 %	0 %	0 %	169834949
100	NC_010418	T	7	7	3273	3279	0 %	100 %	0 %	0 %	169834949
101	NC_010418	CTTT	2	8	3305	3312	0 %	75 %	0 %	25 %	169834949
102	NC_010418	TTA	2	6	3320	3325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
103	NC_010418	TAT	2	6	3383	3388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
104	NC_010418	CTT	2	6	3412	3417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834949
105	NC_010418	ATT	2	6	3453	3458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
106	NC_010418	T	6	6	3461	3466	0 %	100 %	0 %	0 %	169834949
107	NC_010418	AGA	2	6	3469	3474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834949
108	NC_010418	TTC	2	6	3504	3509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834949
109	NC_010418	T	8	8	3618	3625	0 %	100 %	0 %	0 %	169834949
110	NC_010418	TTA	2	6	3685	3690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
111	NC_010418	ATAATT	2	12	3766	3777	50 %	50 %	0 %	0 %	169834949
112	NC_010418	CAG	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834949
113	NC_010418	AAG	2	6	3819	3824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834949
114	NC_010418	CTT	2	6	3834	3839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834949
115	NC_010418	CTA	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834949
116	NC_010418	T	9	9	3960	3968	0 %	100 %	0 %	0 %	169834949
117	NC_010418	TCT	2	6	4029	4034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834949
118	NC_010418	TAT	2	6	4044	4049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
119	NC_010418	CATTT	2	10	4092	4101	20 %	60 %	0 %	20 %	169834949
120	NC_010418	TTA	2	6	4151	4156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
121	NC_010418	AGTT	2	8	4178	4185	25 %	50 %	25 %	0 %	169834949
122	NC_010418	AT	3	6	4218	4223	50 %	50 %	0 %	0 %	169834949
123	NC_010418	T	7	7	4232	4238	0 %	100 %	0 %	0 %	169834949
124	NC_010418	TA	4	8	4260	4267	50 %	50 %	0 %	0 %	169834949
125	NC_010418	TAA	2	6	4274	4279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834949
126	NC_010418	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834949
127	NC_010418	TACT	2	8	4310	4317	25 %	50 %	0 %	25 %	169834949
128	NC_010418	TA	3	6	4329	4334	50 %	50 %	0 %	0 %	169834949
129	NC_010418	T	6	6	4353	4358	0 %	100 %	0 %	0 %	169834949
130	NC_010418	AT	3	6	4367	4372	50 %	50 %	0 %	0 %	169834949
131	NC_010418	GTC	2	6	4407	4412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834949
132	NC_010418	TTTTA	2	10	4437	4446	20 %	80 %	0 %	0 %	169834949
133	NC_010418	ATTT	2	8	4452	4459	25 %	75 %	0 %	0 %	169834949
134	NC_010418	GTT	2	6	4483	4488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834949
135	NC_010418	TTG	2	6	4515	4520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834949
136	NC_010418	TACT	2	8	4537	4544	25 %	50 %	0 %	25 %	169834949
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138	NC_010418	ATC	2	6	4639	4644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834949
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